تنوع ژنتیکی باکتریهای گره زای ریشه یونجه در استان خراسان بر اساس توالی ژن .16s rrna
پایان نامه
- وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه بوعلی سینا - دانشکده علوم کشاورزی
- نویسنده حمید رفیع پور
- استاد راهنما علی دلجو مجید دشتی
- تعداد صفحات: ۱۵ صفحه ی اول
- سال انتشار 1389
چکیده
چکیده: یونجه یکی از گیاهان لگوم است که میزان زیادی علوفه تولید می کند. اغلب گونه های یونجه توانایی قابل توجهی در تثبیت نیتروژن دارند و کیفیت مراتع را در علفزارهای طبیعی و کشت شده بهبود می بخشد. باکتریهای خوانواده ریزوبیاسه قادر به تثبیت اتمسفر در ریشه گیاهان لگومینوزی همچون یونجه هستند. اهداف این تحقیق تعیین تنوع ژنتیکی میان استرین های باکتری گره زای یونجه در نمونه های جدا شده از خاک استان خراسان، شناسایی و آنالیز فیلوژنتیکی و همچنین شناسایی فنوتیپی این باکتری ها بودند. شانزده استرین باکتری از گره ریشه یونجه ایزوله شدند. dnaی آنها استخراج شد و با پرایمرهای یونیورسال برای تکثیر ژن s rrna16 بکار رفتند. مقداری از محصول pcr برای هضم بوسیله چهار آنزیم cfo، haeiii،mspi و hinfi محدود کننده بکار رفت. از قطعه هات بدست آمده از پرایمرهای rd1 و fd1 متعلق به چهار استرین برای توالی یابی ژن srrna16 و بررسی های بیشتر انتخاب گردیدند. برای رسم دندوگرام، قطعات حاصل از pcr-rflp امتیازبندی شده و برای محاسبه تنوع با نرم افزار ntsys-pc بکار رفتند. محصولات pcr با نرم افزار بلاست از پایگاه ncbi و bibi مقایسه شدند. درخت فیلوژنی با روش نیبرجوینینگ با نرم افزار مگا ترسیم شد. نتایج حاصل تنوع بالای ژنتیکی و فنوتیپی در میان باکتریها را آشکار کرد. دندوگرام حاصل pcr-rflp وجود چهار گروه متفاوت را میان باکتریهای بومی نشان داد. بر اساس آنالیز توالی یابی، استرین ها همولوژی بالایی با بعضی از استرین های گونهsinorhizobium meliloti داشتند. این تحقیق اطلاعات شناسایی باکتری های گره زای یونجه را در استان خراسان فراهم می کند. نتایج حاضر تنوع ژنتیکی غنی ریزوبیوم ها را پیشنهاد می کند که می تواند در سطوح اقتصادی و اکوسیستمی با ارزش باشد کلمات کلیدی: ریزوبیوم، یونجه، تنوع ژنتیکی، ژن s rrna16
منابع مشابه
تنوع ژنتیکی میگوی سرتیز Metapenaeus affinis در خلیج فارس بر اساس توالی ژن میتوکندریایی 16S rRNA
میگوی سرتیز رتبه دوم میزان صید میگوی را در استان هرمزگان داشته و در چرخه صید و صیادی خلیج فارس اهمیت زیادی دارد. از این رو، بررسی تنوع ژنتیکی این گونه مهم مد نظر قرار گرفت. نمونههای میگو از سه منطقه بندرعباس، بوشهر و آبادان جمعآوری شدند و برای توالییابی ژن میتوکندریایی 16S rRNA مورد بررسی قرار گرفتند. بهینهسازی واکنش PCR جهت تکثیر ژن انجام شد. نتایج توالییابی ژن 16S rRNA که شامل 486 باز هم...
متن کاملبررسی تنوع ژنتیکی جنسCrassostrea در سواحل بندر امام خمینی با روش تعیین توالی ژن 16S rRNA
16S rRNA یکی از اجزای بخش بزرگ ریبوزومی می باشد که بوسیلهی ژنوم میتوکندریایی کد میشود و به طور گستردهای در مطالعات فیلوژنتیکی مربوط به گونههای نزدیک و به خصوص گونه های مربوط به Crassostrea مورد استفاده قرار میگیرد. پلی مورفیسم توالی نوکلئوتیدی مربوط به ژن 16S rRNA ژنوم میتوکندریایی اویستر خلیج فارس (Crassostrea sp.)، در 30 نمونه اویستر جمع آوری شده از بندر امام خمینی مورد بررسی قرار گرفت. ...
متن کامل"تنوع ژنتیکی باکتری های گره زای ریشه شبدر در استان کردستان "
چکیده: از بین انواع باکتری هائی که در خاک یافت می شو ند باکتریهای همزیست با ریشه دولپه ای ها بیشتر مورد توجه قراردارند. مطالعه تنوع ژنتیکی باکتری های ریزوبیومی و ارزیابی کارایی همزیستی آن ها در جمعیت های بومی خاک و همچنین نقش مدیریت های متفاوت بر تنوع این باکتری ها از اهمیت زیادی برخوردار است. تعیین تنوع ژنتیکی میان جدایه های باکتری های گره زای ریشه شبدر قرمز در مناطقی از خاک استان کردستان، ش...
15 صفحه اولگزارش گونه های نوکاردیای جداسازی شده ازخاک، توسط تعیین توالی ژن 16S rRNA، اصفهان، ایران
مقدمه: جنس نوکاردیا جزو اکتینومیستهای هوازی هستند که یک گروه بزرگ از باکتریهای ساکن خاک را شامل میشوند، که در جهان پخش شدهاند. در این مطالعه، با استفاده از آزمونهای تشخیصی رایج، مرسوم و مولکولی گوناگون، چندین ایزولههای نوکاردیا جداسازی و تشخیص داده شد. مواد و روش ها: در این پژوهش، برای جداسازی از خاک، روش Slip-buried و برای استخراج DNA، روش Microwave oven استفاده شد و در این روشها، سو...
متن کاملتشخیص آناپلاسما اوویس بر اساس ژن 16S rRNA با روش PCR-RFLPدر گوسفندان قسمت مرکزی ایران
خلاصه: واکنش زنجیره ای پلیمراز یکی از اختصاصی ترین روش های تشخیص تفریقی گونه های آناپلاسما می باشد . واکنش زنجیره ای پلیمراز بر اساس ژن 16S rRNA می تواند گونه های جنس آناپلاسما را از یکدیگر تفریق نماید ولی توالی نوکلئوتیدی ژن 16S rRNA در آناپلاسما اوویس بسیار شبیه به آناپلاسما مارجیناله می باشد(9/99%تا 2/99%) و طراحی آغازگرهای اختصاصی برای تکثیر این دو گونه غیر ممکن است. گوسفند و بز می توا...
متن کاملمنابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده{@ msg_add @}
نوع سند: پایان نامه
وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه بوعلی سینا - دانشکده علوم کشاورزی
کلمات کلیدی
میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com
copyright © 2015-2023